160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3652 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
478 aa  947    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  64.98 
 
 
418 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  55.84 
 
 
343 aa  352  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  52.74 
 
 
495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  56.68 
 
 
388 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  56.68 
 
 
388 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  56.68 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  55.45 
 
 
639 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  58.62 
 
 
665 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  52.45 
 
 
899 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  50.58 
 
 
364 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  52.46 
 
 
405 aa  316  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  55.05 
 
 
698 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  51.51 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  48.13 
 
 
362 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  53.66 
 
 
619 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  51.46 
 
 
330 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  51.24 
 
 
759 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  47.91 
 
 
346 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  40.69 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  40.69 
 
 
455 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  38.82 
 
 
416 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  40.14 
 
 
453 aa  227  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  41.16 
 
 
412 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  37.21 
 
 
587 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  37.5 
 
 
425 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  39.3 
 
 
666 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.04 
 
 
552 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  33.04 
 
 
414 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.94 
 
 
532 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  34.67 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  36.36 
 
 
380 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  33.11 
 
 
811 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  34.74 
 
 
319 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.19 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  32.51 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  34.69 
 
 
1160 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  31.77 
 
 
341 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  32.76 
 
 
968 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  32.88 
 
 
926 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  32.77 
 
 
534 aa  133  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  31.45 
 
 
586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  31.71 
 
 
1519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  31.6 
 
 
533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  32.47 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  33.96 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  29.14 
 
 
617 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  30.47 
 
 
544 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  34.26 
 
 
487 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.8 
 
 
334 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  31.76 
 
 
579 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.5 
 
 
659 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  25.87 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  25.17 
 
 
497 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  24.65 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  26.67 
 
 
400 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  24.83 
 
 
485 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
294 aa  57  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  33.33 
 
 
287 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  36.84 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.88 
 
 
397 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  26.09 
 
 
544 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
288 aa  53.5  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.82 
 
 
278 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  32.47 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  28.25 
 
 
265 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  28.25 
 
 
265 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.47 
 
 
2449 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.88 
 
 
290 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  29.41 
 
 
305 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.1 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 
362 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
269 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 
303 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03571  putative septum site-determining protein MinD  27.81 
 
 
271 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.377857  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
299 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  25.14 
 
 
268 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  27.27 
 
 
405 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  27.27 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.97 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21891  putative septum site-determining protein MinD  27.54 
 
 
271 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  25.12 
 
 
550 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  27.42 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  30.65 
 
 
408 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.71 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  28.89 
 
 
271 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
298 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  26.19 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 
266 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  28.89 
 
 
272 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  24.16 
 
 
264 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000334804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>