248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4873 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 		 412 aa  817    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  43.19 
 
 		 639 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  41.16 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  42.47 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  39.31 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  40.24 
 
 		 899 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  43 
 
 		 759 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  41.5 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  38.24 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  43.18 
 
 		 619 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  40.12 
 
 		 771 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  38.51 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  38.51 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  38.51 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  41.22 
 
 		 665 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  40.13 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  43.1 
 
 		 698 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  40.27 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  38.3 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  35.76 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  36.79 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  37.42 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.88 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  33.88 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  35.05 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  31.73 
 
 		 587 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  33.68 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  36.43 
 
 		 666 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  31.86 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  32.16 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  32.16 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  32.16 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  34.11 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  34.11 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  34.11 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.15 
 
 		 532 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  34.43 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  33.9 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  29.8 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  29.53 
 
 		 926 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  29.59 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.94 
 
 		 659 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  30.33 
 
 		 968 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  28.52 
 
 		 1132 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  29.72 
 
 		 1160 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  31.78 
 
 		 544 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  30.31 
 
 		 1519 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  27.45 
 
 		 586 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  28.97 
 
 		 534 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  29.55 
 
 		 811 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  27.27 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  30.35 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  24.3 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  30.08 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  24.74 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.06 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  28.29 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  26.21 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  25.89 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  24.37 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.51 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  27.05 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  25.62 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.5 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  32.93 
 
 		 550 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.64 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  25.77 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  20.77 
 
 		 253 aa  57  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  27.03 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.11 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  29.05 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  24.39 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.71 
 
 		 255 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.28 
 
 		 266 aa  53.5  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 270 aa  53.1  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1299  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.02 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.987107  normal  0.450444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  26.1 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  23.48 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  28.21 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  23.79 
 
 		 249 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.68 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  28.34 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  28 
 
 		 314 aa  50.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  25.63 
 
 		 257 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  23.96 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  25 
 
 		 254 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 		 314 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.62 
 
 		 257 aa  49.7  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.86 
 
 		 261 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>