133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6711 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 495 aa  992    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  73.49 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  66.89 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  66.89 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  66.89 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  64.61 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  63.43 
 
 		 364 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  64 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  60.54 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  60.4 
 
 		 639 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  61 
 
 		 665 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  59.08 
 
 		 899 aa  359  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  54.89 
 
 		 698 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  52.68 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  58.25 
 
 		 619 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  56.89 
 
 		 771 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  54.67 
 
 		 330 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  53.98 
 
 		 759 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  46.71 
 
 		 346 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  43.3 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  42.76 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  39.88 
 
 		 475 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  39.88 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  39.88 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  42.47 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  37.79 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  41.69 
 
 		 666 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  37.38 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  37.5 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.67 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  34.32 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  35.02 
 
 		 587 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  35.92 
 
 		 1132 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  37.01 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.53 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  37.01 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  37.01 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  36.63 
 
 		 1160 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  36.16 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  30.64 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  32.2 
 
 		 926 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1519 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  30.22 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.77 
 
 		 542 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  31.38 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  36.22 
 
 		 968 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.41 
 
 		 811 aa  133  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  31.72 
 
 		 586 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  34.9 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  31.03 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  30.74 
 
 		 617 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.71 
 
 		 544 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  32.99 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.96 
 
 		 334 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  33.21 
 
 		 474 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  33.07 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  29.51 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.21 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  25.32 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.87 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.44 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  24.91 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27250  hypothetical protein  50 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354671  normal  0.303953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  28.46 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.75 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  33.59 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.45 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.54 
 
 		 290 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 317 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.51 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 		 304 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  28.9 
 
 		 550 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.62 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  26.24 
 
 		 848 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.3 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  35.66 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  24.63 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 		 350 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.56 
 
 		 392 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0308  D-alanyl-D-alaninecarboxypeptidase/D-alanyl-D- al anine-endopeptidase  37.8 
 
 		 1016 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 		 272 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 		 387 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.7 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.19 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  35.35 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>