70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3425 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  78.97 
 
 
487 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  67.05 
 
 
334 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  41.61 
 
 
534 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  41.09 
 
 
617 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  42.64 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.23 
 
 
542 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  43.13 
 
 
439 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  41.57 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  33.46 
 
 
478 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  34.98 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  34.98 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  34.98 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  33.64 
 
 
771 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  33.45 
 
 
665 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  32.95 
 
 
639 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  32.13 
 
 
619 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.32 
 
 
418 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  32.33 
 
 
330 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  33.21 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  32.67 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.07 
 
 
698 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  31.08 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  32.81 
 
 
899 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  31.87 
 
 
485 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  32.27 
 
 
494 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.08 
 
 
759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  32.43 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  31.97 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.45 
 
 
405 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  30.99 
 
 
544 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.35 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.69 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  27.65 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  28.42 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  26.32 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  26.24 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.51 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  26.67 
 
 
811 aa  70.1  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  25.52 
 
 
587 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  26.79 
 
 
666 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  25.9 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  22.73 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  25.89 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  25.89 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  25.89 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  26.04 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  30.43 
 
 
319 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  30.43 
 
 
319 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  30.43 
 
 
319 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  27.68 
 
 
544 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  28.93 
 
 
380 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  25.93 
 
 
390 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.04 
 
 
532 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  27.02 
 
 
968 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  25.86 
 
 
1519 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.44 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.57 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.32 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  25.61 
 
 
1160 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 
294 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  23.66 
 
 
926 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.7 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.23 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.86 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.86 
 
 
294 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.03 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  26.7 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>