57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0331 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1156    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  34.49 
 
 
455 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  34.97 
 
 
463 aa  136  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  30.52 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  34.26 
 
 
666 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  30.41 
 
 
475 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  30.41 
 
 
475 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  30.88 
 
 
388 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  30.88 
 
 
388 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  30.88 
 
 
388 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.76 
 
 
478 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.64 
 
 
418 aa  120  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  30.14 
 
 
771 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  29.51 
 
 
495 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  30.21 
 
 
665 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  30.45 
 
 
343 aa  114  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  28.23 
 
 
362 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  31.19 
 
 
899 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.2 
 
 
552 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  30.77 
 
 
639 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  27.52 
 
 
364 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  28.33 
 
 
619 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  30.04 
 
 
425 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  31.25 
 
 
405 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30 
 
 
698 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  26.48 
 
 
414 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  28.92 
 
 
346 aa  98.2  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.97 
 
 
759 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  30.41 
 
 
330 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  92  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  28.91 
 
 
587 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.06 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  27.53 
 
 
1519 aa  86.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  27.3 
 
 
1132 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  24.91 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.86 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  26.35 
 
 
1160 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  27.65 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  28.67 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  30.41 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  30.41 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  30.41 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  25.35 
 
 
926 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  25.33 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  26.92 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  25.84 
 
 
544 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  24.25 
 
 
968 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.32 
 
 
478 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.22 
 
 
542 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  19.55 
 
 
586 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  20.4 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  23.57 
 
 
485 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  24.36 
 
 
811 aa  47  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.17 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  23.91 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.17 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.78 
 
 
494 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>