260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3653 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
418 aa  838    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  57.64 
 
 
478 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  52.16 
 
 
495 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  59.5 
 
 
343 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  53.09 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  57.41 
 
 
665 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  54.93 
 
 
899 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  55.03 
 
 
698 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  53.16 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  53.16 
 
 
388 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  53.16 
 
 
388 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  49.71 
 
 
362 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  49.86 
 
 
364 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  56.49 
 
 
619 aa  316  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  50 
 
 
771 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  50.91 
 
 
405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  51.42 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  51.75 
 
 
759 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  50.31 
 
 
346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  41.5 
 
 
455 aa  239  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  41.5 
 
 
463 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  41.16 
 
 
412 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  38.02 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  35.36 
 
 
414 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  39.08 
 
 
666 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  35.57 
 
 
453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  35.53 
 
 
475 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  35.53 
 
 
475 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  35.53 
 
 
475 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  34.56 
 
 
416 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.71 
 
 
552 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  35.05 
 
 
587 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  39.32 
 
 
319 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  39.32 
 
 
319 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  39.32 
 
 
319 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  32.62 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  36.03 
 
 
1132 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  35.93 
 
 
390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.39 
 
 
532 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  35.79 
 
 
1160 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  34.27 
 
 
341 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  36.01 
 
 
380 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  31.34 
 
 
926 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  32.68 
 
 
534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.57 
 
 
542 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  33.1 
 
 
1519 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  32.14 
 
 
617 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  32.89 
 
 
968 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.1 
 
 
811 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  30.19 
 
 
586 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  31.18 
 
 
533 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  32.78 
 
 
579 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  31.29 
 
 
544 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  31.49 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  32.18 
 
 
474 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  32.81 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.6 
 
 
334 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  25.99 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.08 
 
 
659 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  29.7 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.69 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  24.93 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.09 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.3 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  30.57 
 
 
544 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.23 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  30.64 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  31.05 
 
 
287 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.57 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  26.26 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  30.16 
 
 
550 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.24 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 
270 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1418  cell division ATPase MinD  32.12 
 
 
301 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.986435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.64 
 
 
329 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  28.9 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
367 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
398 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.28 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  28.85 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.44 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.85 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  30.41 
 
 
408 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0481  septum site-determining protein MinD  25.53 
 
 
270 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.747838  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.08 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.88 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 
297 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.04 
 
 
290 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 
259 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  35.92 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.75 
 
 
303 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  25.15 
 
 
300 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
278 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.47 
 
 
257 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
362 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>