54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4508 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  84.14 
 
 
497 aa  778    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  959    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  88.66 
 
 
485 aa  783    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  69.54 
 
 
494 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  33.46 
 
 
534 aa  219  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  35.96 
 
 
533 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  36.67 
 
 
586 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.34 
 
 
542 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  35.89 
 
 
617 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  34.23 
 
 
439 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.57 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  31.7 
 
 
474 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  31.82 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  28.25 
 
 
453 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  31.68 
 
 
639 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  26.23 
 
 
416 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  30.82 
 
 
665 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  30.42 
 
 
899 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  27.64 
 
 
364 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  29.5 
 
 
343 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  27.21 
 
 
619 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  28.71 
 
 
388 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  28.71 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  28.71 
 
 
388 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  27.72 
 
 
771 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.97 
 
 
698 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  29.04 
 
 
330 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  27.83 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  28.62 
 
 
1132 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  28.94 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  29.82 
 
 
968 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  23.03 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  27.97 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.03 
 
 
552 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  26.64 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  27.62 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  26.63 
 
 
759 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  27.15 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  29.21 
 
 
926 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.47 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  27.97 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  26.84 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  24.34 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  25.24 
 
 
811 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  27.92 
 
 
475 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  27.92 
 
 
475 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  27.92 
 
 
475 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  26.58 
 
 
1519 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  23.13 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  25.66 
 
 
666 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  25.99 
 
 
579 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.81 
 
 
544 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
314 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
265 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>