56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0137 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
586 aa  1148    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  69.28 
 
 
533 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  62.61 
 
 
542 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  50 
 
 
534 aa  263  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  43.96 
 
 
617 aa  217  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  37.01 
 
 
439 aa  203  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  42.64 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  39.62 
 
 
334 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  42.25 
 
 
487 aa  183  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  33.85 
 
 
497 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  35.59 
 
 
478 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  34.1 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  37.37 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  37.37 
 
 
494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  33.54 
 
 
665 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  33.33 
 
 
639 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  32.96 
 
 
899 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.56 
 
 
698 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  31.7 
 
 
771 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  31.6 
 
 
619 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  30.56 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.27 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  32.08 
 
 
495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  31.92 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  32.72 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  31.92 
 
 
388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  31.92 
 
 
388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  30.42 
 
 
364 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.57 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  30.43 
 
 
362 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  30.19 
 
 
418 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  29.6 
 
 
330 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  26.77 
 
 
811 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.3 
 
 
453 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  27.17 
 
 
416 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  29.6 
 
 
346 aa  97.8  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  27.24 
 
 
463 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  26.6 
 
 
455 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.77 
 
 
1132 aa  90.5  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.45 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.13 
 
 
552 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  24.73 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  29.48 
 
 
968 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  28.57 
 
 
666 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  25.96 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  25.96 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  25.96 
 
 
475 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  25.19 
 
 
926 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  24.13 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  24.16 
 
 
1160 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  25.29 
 
 
1519 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  25.75 
 
 
544 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  21.84 
 
 
532 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  21.76 
 
 
587 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  24 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.06 
 
 
659 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>