51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0476 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
1160 aa  2279    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  57.45 
 
 
1519 aa  399  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  56.64 
 
 
968 aa  288  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  52.45 
 
 
926 aa  280  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  40.19 
 
 
771 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  38.62 
 
 
665 aa  178  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  38.79 
 
 
330 aa  167  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  36.22 
 
 
639 aa  166  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  34.98 
 
 
619 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  36.64 
 
 
899 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  35.79 
 
 
418 aa  162  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  37.63 
 
 
495 aa  162  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  38.19 
 
 
343 aa  161  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  36.68 
 
 
759 aa  161  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.24 
 
 
698 aa  159  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  38.73 
 
 
405 aa  157  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  38.31 
 
 
364 aa  155  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  36.93 
 
 
388 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  36.93 
 
 
388 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  35.21 
 
 
478 aa  154  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  36.93 
 
 
388 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  35.71 
 
 
362 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  35.52 
 
 
455 aa  144  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  34.81 
 
 
463 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  32.99 
 
 
416 aa  119  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  34.73 
 
 
346 aa  118  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  32.99 
 
 
453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  30.16 
 
 
666 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  30.04 
 
 
587 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.06 
 
 
552 aa  106  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31 
 
 
412 aa  104  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  26.06 
 
 
414 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  29.55 
 
 
390 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  27.65 
 
 
544 aa  93.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  28.77 
 
 
425 aa  91.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.59 
 
 
532 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.05 
 
 
579 aa  73.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.44 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  25.32 
 
 
617 aa  72.4  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  27.74 
 
 
319 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  27.74 
 
 
319 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  27.74 
 
 
319 aa  72  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  29 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  24.14 
 
 
533 aa  71.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  24.9 
 
 
586 aa  71.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  25.09 
 
 
811 aa  68.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  28.62 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  26.55 
 
 
534 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  27.46 
 
 
439 aa  61.6  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  25.65 
 
 
380 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0230  hypothetical protein  30.69 
 
 
134 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>