111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5968 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  99.76 
 
 
414 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
552 aa  1108    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  53.7 
 
 
587 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  34.67 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.97 
 
 
759 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  34.07 
 
 
639 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  33.03 
 
 
478 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  34.24 
 
 
899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  34.03 
 
 
619 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  32.17 
 
 
771 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.35 
 
 
698 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  34.92 
 
 
665 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  34.15 
 
 
388 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  34.15 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  34.15 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  33.44 
 
 
364 aa  180  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  33.62 
 
 
343 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  35.91 
 
 
346 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  32.43 
 
 
455 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  32.65 
 
 
425 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.01 
 
 
412 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  33.11 
 
 
362 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  31.62 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.64 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  31.08 
 
 
475 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  31.08 
 
 
475 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  31.08 
 
 
475 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.77 
 
 
532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  32.51 
 
 
330 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  31.33 
 
 
390 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  33.66 
 
 
380 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.43 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  27.43 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  33.78 
 
 
319 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  33.78 
 
 
319 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  33.78 
 
 
319 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  32.67 
 
 
390 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  26.1 
 
 
926 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  27 
 
 
968 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  28.62 
 
 
341 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  27.55 
 
 
811 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  25.84 
 
 
534 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  26.64 
 
 
1160 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  27.34 
 
 
544 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.29 
 
 
542 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  23.75 
 
 
1132 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  27 
 
 
439 aa  97.4  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  26.2 
 
 
579 aa  94.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  27.8 
 
 
666 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  26.15 
 
 
1519 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  23.1 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.54 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  22.5 
 
 
617 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  22.76 
 
 
533 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  23.37 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.11 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  23.02 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  24.69 
 
 
659 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  22.34 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.69 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  23.51 
 
 
474 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  23.53 
 
 
487 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  22.66 
 
 
400 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.95 
 
 
400 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.64 
 
 
412 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  30.43 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 
278 aa  54.3  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  24.51 
 
 
261 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 
294 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  21.83 
 
 
397 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  23.02 
 
 
397 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 
275 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  26.98 
 
 
285 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.85 
 
 
288 aa  50.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
291 aa  50.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
304 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.36 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  25.76 
 
 
544 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.97 
 
 
402 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  52.63 
 
 
279 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.11 
 
 
350 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
296 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.43 
 
 
295 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.43 
 
 
295 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.4 
 
 
284 aa  47.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  20.74 
 
 
397 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.95 
 
 
387 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  52.63 
 
 
284 aa  47.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.21 
 
 
400 aa  47  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.24 
 
 
294 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2947  chromosome partitioning ATPase  45.83 
 
 
294 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000147107  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.99 
 
 
391 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  28.28 
 
 
415 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  23.93 
 
 
587 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.06 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.89 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.78 
 
 
381 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.22 
 
 
258 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.07 
 
 
423 aa  45.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>