55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0137 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  100 
 
 
1519 aa  2939    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  58.76 
 
 
1160 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  53.36 
 
 
1132 aa  279  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  49.66 
 
 
968 aa  263  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  35.54 
 
 
665 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  64.75 
 
 
926 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  36.03 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  33.1 
 
 
619 aa  148  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.01 
 
 
698 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  36.43 
 
 
639 aa  145  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  35.93 
 
 
388 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  35.93 
 
 
388 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  35.93 
 
 
388 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  33.57 
 
 
899 aa  141  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  33.02 
 
 
495 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  36.47 
 
 
343 aa  138  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  34.42 
 
 
330 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  33.68 
 
 
759 aa  136  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  34.86 
 
 
405 aa  130  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.47 
 
 
478 aa  126  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.06 
 
 
418 aa  126  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  33.22 
 
 
364 aa  126  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  32.33 
 
 
362 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  36.44 
 
 
346 aa  119  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  31.25 
 
 
455 aa  119  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  30.04 
 
 
463 aa  112  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  29.01 
 
 
666 aa  102  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  29.64 
 
 
587 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  31.68 
 
 
453 aa  95.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  32.06 
 
 
416 aa  95.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.15 
 
 
552 aa  90.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  29.2 
 
 
544 aa  89  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.63 
 
 
412 aa  88.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  26.15 
 
 
414 aa  87  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  27.09 
 
 
811 aa  80.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  27.8 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.46 
 
 
579 aa  74.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  26.89 
 
 
425 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  26.22 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  25.29 
 
 
586 aa  63.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  23.94 
 
 
542 aa  62.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  26.52 
 
 
534 aa  58.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.35 
 
 
478 aa  58.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  25.69 
 
 
533 aa  57.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  27 
 
 
497 aa  55.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  27.56 
 
 
494 aa  54.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  28.12 
 
 
390 aa  53.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.62 
 
 
485 aa  52.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  27.45 
 
 
319 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  27.45 
 
 
319 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  27.45 
 
 
319 aa  52.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  27.68 
 
 
380 aa  52  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  26.78 
 
 
439 aa  48.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.42 
 
 
532 aa  47  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  27.45 
 
 
341 aa  45.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>