178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0073 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
619 aa  1218    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  76.53 
 
 
698 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  73.96 
 
 
665 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  70.95 
 
 
639 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  68.26 
 
 
899 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  58.88 
 
 
330 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  61.19 
 
 
343 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  58.25 
 
 
388 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  58.25 
 
 
388 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  58.25 
 
 
388 aa  331  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  58.25 
 
 
495 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  58.19 
 
 
346 aa  318  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  56.49 
 
 
418 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  52.72 
 
 
364 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  53.87 
 
 
362 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  56.25 
 
 
771 aa  306  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  53.66 
 
 
478 aa  300  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  54.93 
 
 
405 aa  299  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  52.92 
 
 
759 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  41.26 
 
 
455 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  37.93 
 
 
453 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  43 
 
 
412 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  37.84 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  39.16 
 
 
463 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  40.91 
 
 
666 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.9 
 
 
552 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  35.96 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  34.03 
 
 
414 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  38.46 
 
 
475 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  38.46 
 
 
475 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  38.46 
 
 
475 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  35.19 
 
 
1132 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  36.19 
 
 
390 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  35.25 
 
 
926 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.44 
 
 
542 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  37.54 
 
 
534 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  35.59 
 
 
968 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  33.1 
 
 
1519 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.27 
 
 
811 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  31.6 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  31.52 
 
 
533 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  34.95 
 
 
319 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  34.95 
 
 
319 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  34.95 
 
 
319 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  30.26 
 
 
425 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.99 
 
 
532 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  32.76 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  29.93 
 
 
617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  32.64 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  32.13 
 
 
474 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  36.23 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  31.89 
 
 
439 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.14 
 
 
334 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  30.56 
 
 
341 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  28.33 
 
 
579 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  27.15 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  26.44 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  27.12 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.44 
 
 
485 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.48 
 
 
659 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 
288 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.65 
 
 
397 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.43 
 
 
2449 aa  58.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 
267 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.88 
 
 
367 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  35.22 
 
 
287 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.97 
 
 
278 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 
278 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  27.81 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
258 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  28.4 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  37.96 
 
 
314 aa  51.6  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  27.88 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  25.24 
 
 
1095 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.56 
 
 
298 aa  50.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  27.83 
 
 
370 aa  50.8  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  27.14 
 
 
400 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.9 
 
 
397 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  30.91 
 
 
265 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  30.91 
 
 
265 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
332 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 
265 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  29.05 
 
 
267 aa  50.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0001  hypothetical protein  33.79 
 
 
353 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.50986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
298 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  27.47 
 
 
266 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
295 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
282 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  27.68 
 
 
270 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 
329 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>