61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4616 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
811 aa  1599    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  34.01 
 
 
665 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  30.63 
 
 
899 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  32.93 
 
 
639 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.39 
 
 
698 aa  154  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  33.11 
 
 
478 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  30.79 
 
 
416 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  30.27 
 
 
619 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  30.9 
 
 
453 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  28.72 
 
 
364 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  32.08 
 
 
771 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  32.36 
 
 
330 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  30.41 
 
 
495 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.42 
 
 
759 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  29.35 
 
 
405 aa  124  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  29.67 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  30.13 
 
 
418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  31.17 
 
 
346 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  30.07 
 
 
343 aa  115  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.34 
 
 
542 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.55 
 
 
552 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  27.12 
 
 
455 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  27.55 
 
 
414 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  26.38 
 
 
586 aa  101  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  27.36 
 
 
533 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  28.62 
 
 
587 aa  100  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  28.25 
 
 
534 aa  94.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  29 
 
 
425 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.77 
 
 
1132 aa  91.3  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.51 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  26.53 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  24.75 
 
 
463 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  27.96 
 
 
926 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  26.38 
 
 
968 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  28.04 
 
 
666 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  27.09 
 
 
1519 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  25.68 
 
 
475 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  25.68 
 
 
475 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  25.68 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.33 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.02 
 
 
659 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  25.97 
 
 
439 aa  66.6  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 
544 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  27.43 
 
 
390 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  25.37 
 
 
1160 aa  65.1  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  26.67 
 
 
474 aa  65.1  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  29.7 
 
 
380 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  26.26 
 
 
497 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  28.57 
 
 
487 aa  61.6  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  28.35 
 
 
390 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  24.94 
 
 
478 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  24.86 
 
 
485 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.03 
 
 
334 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  28.76 
 
 
341 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  24.46 
 
 
267 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>