48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3184 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 		 659 aa  1208    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  67.08 
 
 		 550 aa  253  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  32.16 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.94 
 
 		 412 aa  102  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  32.03 
 
 		 665 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  32.43 
 
 		 698 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.16 
 
 		 759 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  32.79 
 
 		 771 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  34.51 
 
 		 364 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  29.8 
 
 		 899 aa  94.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  31.5 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  31.95 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  31.95 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  31.95 
 
 		 388 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  31.64 
 
 		 362 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  31.56 
 
 		 425 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  29.48 
 
 		 619 aa  87.8  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  29.67 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.86 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  28.02 
 
 		 811 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.48 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  28.03 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  31.73 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  30.33 
 
 		 330 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  28.98 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  25.86 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  27.76 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.68 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  32.22 
 
 		 968 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  27.85 
 
 		 926 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  29.13 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  27.47 
 
 		 666 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  29.8 
 
 		 544 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.04 
 
 		 1132 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.81 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1519 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  26.97 
 
 		 475 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 475 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  26.15 
 
 		 534 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  26.97 
 
 		 475 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.99 
 
 		 397 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  26.26 
 
 		 587 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  30 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  28.1 
 
 		 400 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.17 
 
 		 400 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.89 
 
 		 281 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 243 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>