More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1983 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  56.77 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  53.45 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  50.81 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  51.42 
 
 		 294 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  50.61 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  52.7 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  50.22 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  47.58 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0687  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  44.96 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.432986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  42.23 
 
 		 392 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  42.41 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  39.22 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  41.01 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  38.39 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.39 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  37.86 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  37.75 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  38.35 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  37.98 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  35.92 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  36.4 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  40.7 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  35.41 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.86 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  34.78 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  37.44 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 		 453 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.76 
 
 		 737 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.8 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35.89 
 
 		 217 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.64 
 
 		 464 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  35.22 
 
 		 225 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.05 
 
 		 454 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.5 
 
 		 667 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  38.52 
 
 		 525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 730 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.75 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.64 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.83 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0426  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.63 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0617021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  33.98 
 
 		 741 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  35.22 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.78 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  32.45 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  32.45 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  38.29 
 
 		 790 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.58 
 
 		 615 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.48 
 
 		 496 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.35 
 
 		 466 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  32.45 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  35.86 
 
 		 497 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.46 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  36.04 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  35.75 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.61 
 
 		 463 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.78 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.91 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  32.45 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.72 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 804 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  34.54 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  36.32 
 
 		 722 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  34.29 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  30.68 
 
 		 743 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  33.5 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  34.31 
 
 		 737 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  32.02 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0748  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.03 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  33.18 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  32.14 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  38.38 
 
 		 484 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 780 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4033  chromosome partitioning ATPase  30.88 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  35.44 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31.69 
 
 		 766 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  32.57 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  36.02 
 
 		 492 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  34.23 
 
 		 772 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 524 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  34.76 
 
 		 779 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  32.84 
 
 		 527 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  32.11 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  34.58 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.57 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  38.01 
 
 		 438 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  32.7 
 
 		 509 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  35.32 
 
 		 750 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  33.6 
 
 		 802 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.73 
 
 		 736 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.51 
 
 		 726 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.88 
 
 		 780 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  32.66 
 
 		 734 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  31.74 
 
 		 529 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>