56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4185 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  83.97 
 
 
497 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  88.87 
 
 
478 aa  839    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  70.42 
 
 
494 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  965    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  48.88 
 
 
544 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  35.15 
 
 
534 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  37.04 
 
 
586 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  37.67 
 
 
533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.57 
 
 
542 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  34.21 
 
 
617 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  35.24 
 
 
439 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.6 
 
 
334 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  32.45 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
487 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  27.27 
 
 
453 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  31.18 
 
 
639 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  25.07 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  29.79 
 
 
665 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  30.04 
 
 
899 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  28.38 
 
 
771 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  27.93 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.74 
 
 
698 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  27.18 
 
 
619 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  29.28 
 
 
330 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  28.39 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  27.2 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  28.39 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  28.39 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  28.98 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  25.74 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  27.97 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  29.09 
 
 
968 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  22.47 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.66 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  27.3 
 
 
1132 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  28.46 
 
 
926 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  25.9 
 
 
811 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  26.98 
 
 
759 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  25.83 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.92 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  27.65 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  25.82 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  26.37 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  23.95 
 
 
587 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  27.37 
 
 
475 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  26.88 
 
 
475 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  26.88 
 
 
475 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  26.89 
 
 
1519 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  24.58 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.63 
 
 
544 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  26.07 
 
 
666 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 
314 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  26.36 
 
 
390 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.03 
 
 
293 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>