More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3965 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 262 aa  536  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.95 
 
 		 262 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.95 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.95 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  96.56 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  96.56 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  96.95 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.95 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  96.18 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  91.98 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  91.98 
 
 		 261 aa  494  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  90.46 
 
 		 262 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  89.69 
 
 		 262 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  90.42 
 
 		 262 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  88.21 
 
 		 263 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  90.46 
 
 		 262 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  81.89 
 
 		 257 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  80 
 
 		 264 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  81.89 
 
 		 257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  82.28 
 
 		 257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.92 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  78.63 
 
 		 268 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  78.29 
 
 		 265 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.86 
 
 		 257 aa  424  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  64.37 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.37 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.6 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.98 
 
 		 263 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  64.73 
 
 		 265 aa  359  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.27 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.41 
 
 		 264 aa  358  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  63.74 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  63.74 
 
 		 262 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  64.5 
 
 		 263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  64.12 
 
 		 262 aa  355  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  63.42 
 
 		 262 aa  345  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  61.45 
 
 		 262 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  63.39 
 
 		 266 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  62.6 
 
 		 264 aa  343  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  59.38 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.51 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.2 
 
 		 277 aa  331  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.1 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.31 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.68 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  63.1 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  63.1 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  59.07 
 
 		 265 aa  318  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.4 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.07 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  57.31 
 
 		 261 aa  308  8e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.53 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  57.53 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.09 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  55.29 
 
 		 268 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  61.81 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.35 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.9 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.29 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  61.42 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  55.29 
 
 		 257 aa  301  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  56.75 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  54.58 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  56.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.95 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  54.12 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.58 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.75 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.75 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 		 259 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 		 259 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  56.75 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  55.56 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  54.94 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.51 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.51 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.95 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.48 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  54.76 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  54.76 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.6 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  55.56 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  53.52 
 
 		 257 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.17 
 
 		 259 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  52.17 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.54 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.4 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.4 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>