More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1387 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 		 369 aa  750    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  83.69 
 
 		 371 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  78.93 
 
 		 372 aa  597  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  78.88 
 
 		 374 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  78.34 
 
 		 374 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  79.14 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  79.14 
 
 		 375 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  79.14 
 
 		 375 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  79.14 
 
 		 375 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  79.41 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  78.49 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  75.46 
 
 		 372 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  77.96 
 
 		 372 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  73.71 
 
 		 388 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  71.32 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  71.61 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  64.8 
 
 		 377 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  66.14 
 
 		 380 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  64.06 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  65.77 
 
 		 370 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 379 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  57.49 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  57.18 
 
 		 370 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  57.1 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  56.3 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  55.76 
 
 		 368 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  55.76 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  56.57 
 
 		 374 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  54.23 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  55.2 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  55.17 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.18 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  51.29 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.99 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  53.74 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  50.38 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  45.83 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  46.95 
 
 		 395 aa  332  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.53 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.14 
 
 		 350 aa  298  8e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.08 
 
 		 380 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.35 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  42.7 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.55 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  41.91 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.69 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.01 
 
 		 357 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.71 
 
 		 358 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.87 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.98 
 
 		 350 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.72 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.06 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.71 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.48 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.8 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.8 
 
 		 352 aa  255  8e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  38.5 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.04 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.7 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.34 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.81 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.15 
 
 		 366 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.22 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  38.65 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.02 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  39.29 
 
 		 348 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  38.69 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.85 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  38.78 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.25 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  39.84 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.01 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  37.01 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  38.59 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  37.98 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  37.68 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.38 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  37.36 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  38.67 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.44 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.68 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.72 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  39.39 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  39.39 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  38.02 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  38.25 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  38.24 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  37.74 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  37.74 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.4 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.13 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.08 
 
 		 377 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.23 
 
 		 364 aa  235  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  36.34 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>