More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3906 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  95.74 
 
 		 370 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 		 376 aa  766    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  89.92 
 
 		 374 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  95.48 
 
 		 370 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  84.8 
 
 		 375 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  87.57 
 
 		 378 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  83.2 
 
 		 368 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  82.67 
 
 		 368 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3433  chemotaxis-specific methylesterase  81.09 
 
 		 386 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.891132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  61.2 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  58.95 
 
 		 377 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  59.79 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  62.47 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  58.67 
 
 		 371 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  60.27 
 
 		 370 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  59.21 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  57.33 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  58.95 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  59.32 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  57.85 
 
 		 375 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  57.14 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  57.33 
 
 		 375 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  57.33 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  57.33 
 
 		 375 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  59.68 
 
 		 371 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  57.26 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  54.27 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  54.76 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  57.07 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  56.06 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.68 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  54.96 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  53.96 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  53.98 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  52.57 
 
 		 369 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  49.74 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  50.79 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1983  protein-glutamate methylesterase CheB  93.65 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.36 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  49.87 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.83 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.09 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.45 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.77 
 
 		 350 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  46.19 
 
 		 369 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  43.05 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.45 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.47 
 
 		 424 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.88 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  41.6 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.25 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.51 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.32 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.84 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.05 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.77 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  41.49 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  40.64 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.96 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  39.57 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.12 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.19 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  40.53 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  38.93 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.67 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.46 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.09 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.73 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.87 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.85 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.46 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  38.12 
 
 		 371 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  37.61 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.83 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  39.26 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.2 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.37 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.36 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  38.03 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.52 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  39.67 
 
 		 359 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.1 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.1 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.73 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  39.84 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.63 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  38.61 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.3 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.32 
 
 		 371 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.14 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  34.12 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.17 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0763  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.56 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  38.3 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.8 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.22 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.23 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>