More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0978 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  100 
 
 
352 aa  714    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  54.8 
 
 
353 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1985  Protein-glutamate methylesterase  52.59 
 
 
341 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0052895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.71 
 
 
355 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  50.14 
 
 
364 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  51.01 
 
 
362 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0615  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.85 
 
 
347 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0496998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1329  protein-glutamate methylesterase  49.43 
 
 
341 aa  341  9e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  49.3 
 
 
363 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0807  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.72 
 
 
347 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.41 
 
 
343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  47.99 
 
 
363 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  52.21 
 
 
352 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  47.55 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  49.01 
 
 
363 aa  335  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  47.26 
 
 
350 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  46.69 
 
 
375 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  46.69 
 
 
375 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.84 
 
 
376 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.44 
 
 
356 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.07 
 
 
365 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.14 
 
 
365 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.16 
 
 
356 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  47.55 
 
 
349 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  47.58 
 
 
364 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  48.13 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  47.61 
 
 
363 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 
349 aa  331  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  48.99 
 
 
349 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  47.26 
 
 
356 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 
349 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  48.13 
 
 
349 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 
349 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
360 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 
349 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  49.11 
 
 
349 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  47.84 
 
 
349 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  47.26 
 
 
350 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  46.7 
 
 
363 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  47.55 
 
 
350 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
360 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  50 
 
 
349 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 
363 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  49.12 
 
 
349 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
363 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  46.13 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  47.84 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  48.18 
 
 
348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.3 
 
 
371 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  45.45 
 
 
355 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  46.49 
 
 
349 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  46.53 
 
 
359 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  47.81 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  47.71 
 
 
362 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.09 
 
 
354 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  46.24 
 
 
357 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.43 
 
 
362 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  45.69 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  45.69 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  45.69 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  48.59 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.88 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  46.42 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  44.41 
 
 
381 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.31 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  46.78 
 
 
353 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  45.95 
 
 
364 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.87 
 
 
355 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2711  chemotaxis-specific methylesterase  50.87 
 
 
350 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  46.86 
 
 
362 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  45.88 
 
 
362 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.38 
 
 
364 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.4 
 
 
340 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  46.51 
 
 
359 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.1 
 
 
356 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  46.29 
 
 
362 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  45.92 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  44.8 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.25 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  45.74 
 
 
358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.53 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.33 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  46.95 
 
 
345 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.99 
 
 
353 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  46.29 
 
 
358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  45.66 
 
 
339 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>