More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4166 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  91.34 
 
 
381 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
375 aa  758    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
375 aa  758    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  70.89 
 
 
356 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  69.81 
 
 
356 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  67.2 
 
 
360 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  66.76 
 
 
363 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  66.31 
 
 
363 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  67.9 
 
 
364 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  68.92 
 
 
355 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  67.56 
 
 
359 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  67.64 
 
 
364 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  66.67 
 
 
360 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  69 
 
 
357 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  66.67 
 
 
360 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  66.67 
 
 
360 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  66.22 
 
 
363 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  68.01 
 
 
367 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  64.78 
 
 
363 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  65.14 
 
 
353 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  67.2 
 
 
362 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  65.05 
 
 
362 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  63.51 
 
 
363 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  63.78 
 
 
350 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  62.3 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  63.24 
 
 
350 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  63.51 
 
 
350 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  64.05 
 
 
350 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  62.97 
 
 
349 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  62.97 
 
 
363 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  62.9 
 
 
349 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  63.24 
 
 
354 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  61.22 
 
 
362 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  62.71 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  61.66 
 
 
349 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  61.68 
 
 
377 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  61.39 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  61.66 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  61.89 
 
 
349 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  62.05 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
349 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  61.89 
 
 
349 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  61.77 
 
 
370 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  61.1 
 
 
368 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  60.32 
 
 
384 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.34 
 
 
373 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  53.39 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  55.12 
 
 
364 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  55.01 
 
 
349 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  57.67 
 
 
349 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55 
 
 
356 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  55.04 
 
 
352 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  53.99 
 
 
354 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.08 
 
 
378 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.72 
 
 
356 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.42 
 
 
354 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.71 
 
 
350 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55 
 
 
365 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  53.04 
 
 
355 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.44 
 
 
365 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.15 
 
 
356 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  53.48 
 
 
357 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.22 
 
 
355 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  52.55 
 
 
358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  51.38 
 
 
379 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.65 
 
 
357 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.1 
 
 
364 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.34 
 
 
356 aa  359  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  53.19 
 
 
349 aa  358  8e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  50.99 
 
 
359 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  50.97 
 
 
356 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  48.92 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.47 
 
 
371 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  51.79 
 
 
362 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.67 
 
 
362 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.77 
 
 
363 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  50.69 
 
 
363 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.67 
 
 
362 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3548  chemotaxis-specific methylesterase  52.22 
 
 
358 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  49.86 
 
 
364 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.29 
 
 
355 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  49.18 
 
 
358 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  49.17 
 
 
358 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.32 
 
 
351 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>