More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1757 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  99.43 
 
 
349 aa  708    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
349 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  95.13 
 
 
349 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  99.43 
 
 
349 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  99.71 
 
 
349 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  98.85 
 
 
349 aa  703    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  99.14 
 
 
349 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  94.56 
 
 
349 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  99.43 
 
 
349 aa  708    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  92.26 
 
 
349 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  94.84 
 
 
349 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  99.14 
 
 
349 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  99.43 
 
 
349 aa  708    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  95.13 
 
 
349 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  94.84 
 
 
349 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  85.71 
 
 
350 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  86 
 
 
350 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  85.71 
 
 
350 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  84.81 
 
 
349 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  85.71 
 
 
350 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  84.53 
 
 
349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  84.53 
 
 
349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  84.53 
 
 
349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  69.71 
 
 
353 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  71.02 
 
 
354 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  68.38 
 
 
363 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  68.66 
 
 
360 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  68.84 
 
 
364 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  67.71 
 
 
363 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  68.38 
 
 
360 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  68.38 
 
 
360 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  68.38 
 
 
360 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  67.51 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  68.26 
 
 
362 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  67.32 
 
 
367 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  66.28 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  64.59 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  66.67 
 
 
363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  67.34 
 
 
359 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  66.86 
 
 
356 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  67.83 
 
 
357 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  62.16 
 
 
375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  62.29 
 
 
363 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  60.56 
 
 
362 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  61.47 
 
 
363 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  59.31 
 
 
381 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  60.34 
 
 
363 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.06 
 
 
373 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.03 
 
 
384 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.43 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.34 
 
 
377 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.15 
 
 
370 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  57.51 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.95 
 
 
366 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  58.16 
 
 
349 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.36 
 
 
368 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  55.52 
 
 
348 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  59.39 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  55.62 
 
 
352 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  52.62 
 
 
357 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.94 
 
 
364 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  54.31 
 
 
358 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  54.28 
 
 
349 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  51.54 
 
 
364 aa  361  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
349 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  50.28 
 
 
354 aa  358  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.59 
 
 
356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  51.57 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  53.18 
 
 
353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.59 
 
 
356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.72 
 
 
355 aa  355  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
354 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.14 
 
 
351 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  47.47 
 
 
376 aa  350  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.84 
 
 
363 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.86 
 
 
351 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.14 
 
 
351 aa  349  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  50.87 
 
 
351 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  50.6 
 
 
345 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.3 
 
 
356 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.71 
 
 
350 aa  346  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  50.14 
 
 
364 aa  345  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  50.7 
 
 
363 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.43 
 
 
356 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  48.57 
 
 
351 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.42 
 
 
365 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.49 
 
 
343 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.02 
 
 
378 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50 
 
 
362 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.98 
 
 
365 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>