More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3499 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  100 
 
 
339 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  70.67 
 
 
345 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.06 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  64.81 
 
 
348 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  55.62 
 
 
357 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  57.53 
 
 
349 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.94 
 
 
350 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  55.91 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  49.73 
 
 
376 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  54.71 
 
 
348 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  53.57 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 
362 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50 
 
 
366 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.86 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  48.27 
 
 
355 aa  342  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  51.14 
 
 
362 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  49.57 
 
 
363 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  49 
 
 
363 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  49 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 
360 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 
360 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 
360 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  48.99 
 
 
356 aa  338  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  49.44 
 
 
363 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  52.37 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.72 
 
 
373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  50.89 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  50.89 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  49.56 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.98 
 
 
384 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  50.3 
 
 
349 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  49 
 
 
363 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  50.3 
 
 
349 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 
364 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  48.73 
 
 
363 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  49.85 
 
 
350 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  49.26 
 
 
350 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  49.11 
 
 
349 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  48.44 
 
 
363 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  49.26 
 
 
350 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  49.26 
 
 
350 aa  328  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  50.59 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  50.59 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  50.59 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  50.59 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  50.59 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  48.82 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  48.82 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  48.51 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  48.82 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.29 
 
 
343 aa  325  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  49.44 
 
 
367 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.29 
 
 
368 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  48.56 
 
 
359 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.88 
 
 
370 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.88 
 
 
370 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  49.57 
 
 
362 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  46.96 
 
 
375 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  46.96 
 
 
375 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0154  protein-glutamate methylesterase CheB  49.69 
 
 
346 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  51.01 
 
 
352 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  50.88 
 
 
341 aa  315  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  48.26 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3626  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  47.04 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  45.65 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.83 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.41 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  48.84 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.13 
 
 
351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.66 
 
 
352 aa  309  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.7 
 
 
364 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  46.89 
 
 
354 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.92 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  44.79 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1985  Protein-glutamate methylesterase  48.54 
 
 
341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0052895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  46.84 
 
 
351 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0333  chemotaxis-specific methylesterase  48.97 
 
 
347 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  49.41 
 
 
349 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  49.11 
 
 
345 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  46.76 
 
 
379 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  46.33 
 
 
395 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  48.06 
 
 
349 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.96 
 
 
349 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.4 
 
 
354 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.67 
 
 
349 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  45.58 
 
 
358 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>