More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1377 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
356 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.89 
 
 
367 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.97 
 
 
380 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  53.8 
 
 
369 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  43.75 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  41.76 
 
 
372 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  43.49 
 
 
369 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.71 
 
 
353 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  42.59 
 
 
374 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  42.23 
 
 
375 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  41.69 
 
 
375 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  43.21 
 
 
374 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  41.69 
 
 
375 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  41.69 
 
 
375 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  42.03 
 
 
372 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  40.26 
 
 
388 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  42.23 
 
 
371 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.33 
 
 
357 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  41.85 
 
 
372 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  41.51 
 
 
374 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  39.64 
 
 
393 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  41.96 
 
 
370 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  40.65 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  42.93 
 
 
370 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  39.28 
 
 
390 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  41.39 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  42.36 
 
 
375 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
379 aa  266  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  41.23 
 
 
362 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.57 
 
 
364 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  39.78 
 
 
370 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  43.82 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.22 
 
 
350 aa  262  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
363 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.08 
 
 
369 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
360 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
363 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  42.02 
 
 
349 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  41.44 
 
 
376 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  39.94 
 
 
371 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.66 
 
 
366 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  40.86 
 
 
380 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  39.95 
 
 
374 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  42.05 
 
 
368 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  38.48 
 
 
377 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  39.66 
 
 
356 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  41.78 
 
 
368 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.53 
 
 
368 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.23 
 
 
340 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  39.55 
 
 
350 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.08 
 
 
354 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  39.27 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.1 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.04 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.22 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.66 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  39.55 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  39.05 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.4 
 
 
366 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.45 
 
 
358 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  40.06 
 
 
362 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.23 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  39.27 
 
 
350 aa  252  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  40.26 
 
 
395 aa  252  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  42.02 
 
 
349 aa  252  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  38.76 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  38.76 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  38.76 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  40.42 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.6 
 
 
392 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.29 
 
 
377 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  39.71 
 
 
350 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  38.81 
 
 
349 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  39.83 
 
 
360 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  39.83 
 
 
360 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  39.83 
 
 
360 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  38.81 
 
 
349 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  41.08 
 
 
353 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  39.22 
 
 
364 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
349 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  37.99 
 
 
349 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
363 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.82 
 
 
366 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.9 
 
 
424 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
349 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.72 
 
 
364 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
349 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>