More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1650 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  82.25 
 
 
370 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
377 aa  763    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  83.82 
 
 
371 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  78.29 
 
 
380 aa  599  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  67.46 
 
 
375 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  67.2 
 
 
375 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  67.2 
 
 
375 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  66.93 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  64.9 
 
 
398 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  64.77 
 
 
388 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  67.2 
 
 
374 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  66.49 
 
 
372 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  65.78 
 
 
374 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  66.76 
 
 
372 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  65.87 
 
 
369 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  65.07 
 
 
371 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  65.16 
 
 
374 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  64.89 
 
 
372 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  63.49 
 
 
371 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  63.23 
 
 
379 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  61.36 
 
 
393 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  58.49 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  58.49 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  60.05 
 
 
368 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  60.64 
 
 
368 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  57.94 
 
 
376 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  59.25 
 
 
375 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  55.79 
 
 
381 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  57.1 
 
 
374 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  57.82 
 
 
378 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  56.08 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.41 
 
 
361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  54.97 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  54.35 
 
 
354 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  49.23 
 
 
365 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  48.1 
 
 
390 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.32 
 
 
368 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  46.55 
 
 
395 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.67 
 
 
350 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.48 
 
 
353 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.37 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  41.89 
 
 
362 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.32 
 
 
358 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.87 
 
 
380 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.59 
 
 
424 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  41.07 
 
 
349 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  39.78 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.71 
 
 
364 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.26 
 
 
357 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.05 
 
 
357 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.7 
 
 
361 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.2 
 
 
356 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
365 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.86 
 
 
366 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
344 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.45 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  39.52 
 
 
344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  39.84 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.44 
 
 
352 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.65 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.95 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.13 
 
 
346 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.71 
 
 
366 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
344 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  41.23 
 
 
362 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39 
 
 
366 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  37.84 
 
 
372 aa  246  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  41.64 
 
 
359 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.05 
 
 
360 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.93 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.87 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.44 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.16 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  40.8 
 
 
363 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.2 
 
 
369 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.6 
 
 
358 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  36.29 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  39.95 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  38.86 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.27 
 
 
384 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0087  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.13 
 
 
377 aa  238  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.515449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  40.43 
 
 
363 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  39.95 
 
 
353 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
358 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  41.02 
 
 
359 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  40.48 
 
 
363 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 
375 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  39.14 
 
 
349 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 
375 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  38.44 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.73 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.9 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  37.9 
 
 
349 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
355 aa  236  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.73 
 
 
351 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
349 aa  236  7e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  38.24 
 
 
364 aa  235  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
349 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
349 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>