More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0702 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 		 384 aa  767    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  73.44 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  70.43 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  68.55 
 
 		 366 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.2 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.65 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.65 
 
 		 370 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  63.87 
 
 		 368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  60.16 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  57.07 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  58.22 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  59.27 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  59.11 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  59.16 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  59.11 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  59.57 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  58.47 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  59.57 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  59.11 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  59.11 
 
 		 360 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  57.29 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  58.9 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  56.69 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  57.07 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  57.37 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  57.59 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  59.57 
 
 		 381 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  55.7 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  56.43 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  55.44 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  57.59 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  57.33 
 
 		 350 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  58.38 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  56.96 
 
 		 349 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  58.9 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  56.53 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  56.53 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  56.53 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  58.85 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  58.33 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  57.22 
 
 		 349 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  58.07 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  55.5 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  55.03 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  54.99 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  50.79 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  53.66 
 
 		 358 aa  362  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  50.4 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  51.89 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  52.62 
 
 		 349 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  47.86 
 
 		 376 aa  352  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  48.39 
 
 		 354 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.67 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  48.66 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.27 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  50.53 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.1 
 
 		 356 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.24 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  47.47 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.9 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.87 
 
 		 350 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  47.33 
 
 		 353 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  49.05 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.93 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3301  protein-glutamate methylesterase  47.33 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.03 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  49.05 
 
 		 358 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.67 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  50 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  48.52 
 
 		 339 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  49.06 
 
 		 363 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.95 
 
 		 340 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  52.16 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.87 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  51.35 
 
 		 395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.67 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.64 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.73 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.13 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  45.33 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  46.51 
 
 		 348 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0087  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.5 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.515449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  50.27 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>