More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3301 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3301  protein-glutamate methylesterase  100 
 
 		 358 aa  727    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  66.29 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  65.91 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  66.01 
 
 		 351 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  65.16 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3801  chemotaxis-specific methylesterase  64.02 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3548  chemotaxis-specific methylesterase  65.63 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  60.97 
 
 		 379 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  60.22 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  58.24 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  58.64 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1526  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.37 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.131031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.24 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  58.92 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.37 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  58.43 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  56.34 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.06 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  57.71 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.97 
 
 		 356 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.53 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.41 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.21 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.3 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.14 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.29 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.57 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.34 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.34 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  53.35 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  51.14 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  53.11 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  52.29 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4668  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  56.18 
 
 		 368 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275647  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4820  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.29 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.305124  hitchhiker  0.00546369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.54 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  50.57 
 
 		 362 aa  358  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 363 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  50.28 
 
 		 363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0626  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.91 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  48.07 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  48.07 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.99 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  46.63 
 
 		 376 aa  348  6e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 356 aa  346  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  49.57 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  49 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  48.72 
 
 		 349 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.73 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 350 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  48.72 
 
 		 349 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  49.45 
 
 		 367 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  48.22 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.58 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.42 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0644  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.28 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.173945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  48 
 
 		 355 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  50.57 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  47.56 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  47.86 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  47.71 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.01 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  49.29 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.13 
 
 		 373 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.73 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>