More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3801 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3801  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
350 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  86 
 
 
351 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3548  chemotaxis-specific methylesterase  74.44 
 
 
358 aa  511  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  71.27 
 
 
379 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  65.44 
 
 
358 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  66.18 
 
 
359 aa  471  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  64.31 
 
 
358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  65.06 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3301  protein-glutamate methylesterase  64.02 
 
 
358 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1564  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.54 
 
 
355 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.736792  normal  0.583275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  60.62 
 
 
354 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  60.8 
 
 
355 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  60.17 
 
 
356 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.6 
 
 
356 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.77 
 
 
355 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.88 
 
 
354 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.07 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  61.21 
 
 
362 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.22 
 
 
356 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1526  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.38 
 
 
370 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.131031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  56.7 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.86 
 
 
378 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.6 
 
 
362 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.6 
 
 
362 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  55.87 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.42 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.19 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  58.45 
 
 
364 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  59.43 
 
 
363 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  56.34 
 
 
363 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.77 
 
 
371 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  56.57 
 
 
364 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.88 
 
 
356 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.59 
 
 
365 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  51.3 
 
 
362 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4668  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  59.43 
 
 
368 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275647  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4820  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.2 
 
 
361 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.305124  hitchhiker  0.00546369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  50.29 
 
 
363 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  49.58 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  49.3 
 
 
363 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.45 
 
 
343 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  47.53 
 
 
375 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  47.53 
 
 
375 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  48.86 
 
 
349 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  51.72 
 
 
357 aa  345  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  48 
 
 
349 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  48 
 
 
349 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  48 
 
 
349 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  48 
 
 
349 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  49.01 
 
 
364 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  47.43 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  49 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  47.14 
 
 
350 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  47.43 
 
 
350 aa  342  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0644  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.01 
 
 
358 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.173945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 
360 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  47.46 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  48.6 
 
 
364 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  47.46 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  47.46 
 
 
360 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  47.14 
 
 
350 aa  339  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  48.57 
 
 
363 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  47.71 
 
 
349 aa  339  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  47.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  47.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  47.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  47.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  47.71 
 
 
349 aa  338  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  47.43 
 
 
349 aa  338  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.43 
 
 
349 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0626  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.06 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  47.73 
 
 
363 aa  335  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  47.28 
 
 
381 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  47.14 
 
 
349 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  46 
 
 
349 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  46.06 
 
 
348 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  47.43 
 
 
349 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  50 
 
 
352 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  47.43 
 
 
349 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  46.22 
 
 
356 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  47.14 
 
 
349 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2484  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.4 
 
 
356 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.900562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  46.13 
 
 
356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2580  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  56.1 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  47.14 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1373  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  56.2 
 
 
356 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 
359 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  46.55 
 
 
353 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  45.76 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  46.72 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.73 
 
 
377 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.14 
 
 
356 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  47.21 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  47.31 
 
 
362 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  47.31 
 
 
362 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>