More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3045 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 		 371 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  83.29 
 
 		 369 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  79.95 
 
 		 374 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  79.47 
 
 		 372 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  79.14 
 
 		 374 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  78.82 
 
 		 375 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  79.62 
 
 		 372 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  78.82 
 
 		 375 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  78.82 
 
 		 375 aa  597  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  78.82 
 
 		 375 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  78.72 
 
 		 374 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  78.61 
 
 		 372 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  78.46 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  72.77 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  73.2 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  71.36 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  66.31 
 
 		 370 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  66.4 
 
 		 371 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  65.07 
 
 		 377 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  65.61 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  56.77 
 
 		 379 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  58.81 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  54.5 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  54.88 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  54.38 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  55.2 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  55.23 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  55.17 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  53.8 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.87 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  53.32 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  53.76 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  52.66 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.94 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  50.26 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  51.86 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  47.5 
 
 		 395 aa  335  9e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  46.34 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.05 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.75 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.52 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.27 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  43.29 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.31 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.15 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  42.35 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.13 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.6 
 
 		 357 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  40.44 
 
 		 348 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.71 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.07 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  40.16 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  40.44 
 
 		 364 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.55 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  40.55 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.83 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.22 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.55 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.21 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.12 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.6 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  39.19 
 
 		 356 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  37.26 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.05 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  39.3 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  40.06 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.54 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  40.11 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.53 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.53 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.55 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.95 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  38.74 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  38.74 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.83 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  37.74 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.11 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.57 
 
 		 358 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  37.87 
 
 		 356 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.19 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  38.38 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  37.94 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.46 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  38.75 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  38.03 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  38.98 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  37.94 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  38.48 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  38.57 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.98 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.39 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  39.39 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.99 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  38.98 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.53 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>