More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0489 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
354 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.46 
 
 
356 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  50.57 
 
 
365 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  48.28 
 
 
349 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0873  protein-glutamate methylesterase  45.69 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.73 
 
 
365 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.64 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.45 
 
 
362 aa  292  8e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  44.61 
 
 
350 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.9 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  44.22 
 
 
350 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2691  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.19 
 
 
372 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  42.86 
 
 
356 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  42.69 
 
 
363 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  45.09 
 
 
344 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 
366 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.22 
 
 
366 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  43.73 
 
 
350 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  43.73 
 
 
350 aa  279  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  45.09 
 
 
344 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  42.57 
 
 
363 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  41.93 
 
 
356 aa  279  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  44.15 
 
 
349 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  41.14 
 
 
359 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.15 
 
 
349 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  44.74 
 
 
352 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.64 
 
 
354 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  44.13 
 
 
351 aa  276  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  42.41 
 
 
360 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  42.41 
 
 
360 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  42.41 
 
 
360 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  43.57 
 
 
349 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  43.27 
 
 
349 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  42.54 
 
 
364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  43.86 
 
 
349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  41.64 
 
 
363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  41.95 
 
 
357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  42.45 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  41.5 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  41.24 
 
 
360 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  43.86 
 
 
349 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  41.24 
 
 
363 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  42.65 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  43.57 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.3 
 
 
346 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.38 
 
 
355 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  43.27 
 
 
349 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  43.06 
 
 
362 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  42.32 
 
 
345 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.07 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.34 
 
 
361 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  40.46 
 
 
344 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.97 
 
 
364 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  40.94 
 
 
349 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  41.76 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.94 
 
 
353 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  40.29 
 
 
349 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 
363 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 
354 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  40.9 
 
 
367 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  41.29 
 
 
362 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.5 
 
 
367 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.9 
 
 
375 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.9 
 
 
375 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  40.91 
 
 
362 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.66 
 
 
364 aa  263  4e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.79 
 
 
350 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  38.59 
 
 
372 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.45 
 
 
419 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.54 
 
 
363 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  40.64 
 
 
348 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  41.4 
 
 
349 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  41.4 
 
 
349 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  41.4 
 
 
349 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.95 
 
 
349 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  39.72 
 
 
356 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.95 
 
 
349 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.95 
 
 
349 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.39 
 
 
369 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
374 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  38.21 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  39.03 
 
 
355 aa  259  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
355 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.53 
 
 
356 aa  258  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  39.46 
 
 
374 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  38.34 
 
 
375 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.44 
 
 
356 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  44.09 
 
 
345 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>