More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1639 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
372 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  79.47 
 
 
371 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  74.23 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  76.34 
 
 
369 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  71.91 
 
 
374 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  71.25 
 
 
393 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  73.8 
 
 
375 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  73.8 
 
 
375 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  74.06 
 
 
375 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  73.53 
 
 
375 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  72.77 
 
 
374 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  74.54 
 
 
372 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  73.16 
 
 
371 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  72.14 
 
 
374 aa  554  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  72.94 
 
 
372 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  70.18 
 
 
398 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  64.17 
 
 
377 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  64.59 
 
 
371 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  63.51 
 
 
370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  64.29 
 
 
380 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  56.54 
 
 
379 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  55.31 
 
 
369 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  53.3 
 
 
379 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  53.89 
 
 
370 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  55.47 
 
 
375 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.96 
 
 
361 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  53.08 
 
 
374 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  55.01 
 
 
370 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  55.14 
 
 
376 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  54.25 
 
 
368 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  54.95 
 
 
368 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  50.66 
 
 
381 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  52.42 
 
 
354 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.99 
 
 
368 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  47.93 
 
 
390 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  44.09 
 
 
365 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 
367 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.76 
 
 
356 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.21 
 
 
380 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.41 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  42.66 
 
 
369 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.1 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.86 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  42.51 
 
 
362 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.51 
 
 
357 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.73 
 
 
350 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.87 
 
 
364 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3269  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  41.03 
 
 
357 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208598  hitchhiker  0.000350875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.52 
 
 
424 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  40.88 
 
 
362 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.59 
 
 
354 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.71 
 
 
352 aa  262  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  39.24 
 
 
348 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  38.59 
 
 
365 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.29 
 
 
364 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.81 
 
 
366 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  38.21 
 
 
355 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  39.3 
 
 
364 aa  255  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.77 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.67 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2439  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.87 
 
 
369 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.52 
 
 
361 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.29 
 
 
366 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.46 
 
 
358 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  38.25 
 
 
353 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.21 
 
 
392 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.78 
 
 
358 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  38.86 
 
 
339 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  37.36 
 
 
362 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.74 
 
 
356 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  38.65 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  38.74 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.42 
 
 
364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  38.71 
 
 
352 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.61 
 
 
344 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.26 
 
 
384 aa  245  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.98 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  39.2 
 
 
351 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  38.46 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  38.46 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  38.33 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.84 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 
370 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  37.16 
 
 
356 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  37.33 
 
 
344 aa  243  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.46 
 
 
373 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  37.74 
 
 
364 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.36 
 
 
370 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  37.84 
 
 
354 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.11 
 
 
361 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.08 
 
 
366 aa  242  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  38.69 
 
 
349 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  39.23 
 
 
363 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  37.64 
 
 
356 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.21 
 
 
377 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.89 
 
 
362 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  37.27 
 
 
349 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.43 
 
 
365 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  38.08 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>