More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1203 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
398 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  77.44 
 
 
374 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  77.5 
 
 
375 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  77.25 
 
 
375 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  77.67 
 
 
374 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  78.64 
 
 
372 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  77.5 
 
 
375 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  77 
 
 
375 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  77.14 
 
 
372 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  76.88 
 
 
374 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  75.62 
 
 
388 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  73.12 
 
 
393 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  72.61 
 
 
371 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  71.36 
 
 
371 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  71.11 
 
 
369 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  70.18 
 
 
372 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  64.47 
 
 
377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  63.45 
 
 
370 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  63.71 
 
 
371 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  63.45 
 
 
380 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  58.25 
 
 
379 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  54.76 
 
 
369 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  53.69 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  53.44 
 
 
370 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  54.29 
 
 
379 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1567  chemotaxis-specific methylesterase  53.44 
 
 
378 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  53.94 
 
 
376 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  52.93 
 
 
375 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3433  chemotaxis-specific methylesterase  54.82 
 
 
386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.891132  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  53.67 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  54.71 
 
 
368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  52.42 
 
 
368 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  51.26 
 
 
381 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.71 
 
 
361 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.3 
 
 
368 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  49.62 
 
 
390 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  48.61 
 
 
354 aa  358  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  43.65 
 
 
365 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0473  chemotaxis-specific methylesterase  46.13 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0780  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.37 
 
 
380 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.039887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.36 
 
 
367 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.79 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.9 
 
 
424 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  41.77 
 
 
369 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.03 
 
 
358 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  39.44 
 
 
362 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.69 
 
 
356 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.93 
 
 
364 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.09 
 
 
357 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.52 
 
 
366 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.52 
 
 
366 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.77 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  38.17 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  36.64 
 
 
348 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.97 
 
 
365 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.03 
 
 
352 aa  250  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  38.83 
 
 
355 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.8 
 
 
354 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  39.29 
 
 
353 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.89 
 
 
366 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  35.64 
 
 
372 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.06 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.29 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  35.19 
 
 
365 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.83 
 
 
350 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.15 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 
358 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4029  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.63 
 
 
358 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000141988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.87 
 
 
364 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.87 
 
 
349 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
356 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.5 
 
 
362 aa  239  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  36.92 
 
 
353 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.36 
 
 
349 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  36.67 
 
 
356 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.36 
 
 
349 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  36.11 
 
 
364 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.11 
 
 
349 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  35.2 
 
 
349 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.32 
 
 
392 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.29 
 
 
364 aa  235  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.4 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.57 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  37.08 
 
 
363 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  36.83 
 
 
363 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  36.83 
 
 
360 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  36.02 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
375 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  37.69 
 
 
359 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
375 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  34.18 
 
 
344 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  36.11 
 
 
350 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.3 
 
 
363 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.67 
 
 
363 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  33.93 
 
 
344 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 
356 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 
365 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  33.84 
 
 
364 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.55 
 
 
365 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  36.48 
 
 
352 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>