More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5003 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
371 aa  720    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  62.5 
 
 
419 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  65.83 
 
 
366 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  57.63 
 
 
370 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.42 
 
 
385 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.28 
 
 
352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.66 
 
 
355 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  54.42 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.91 
 
 
394 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.71 
 
 
353 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  44.07 
 
 
401 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  41.8 
 
 
365 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  43.02 
 
 
344 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  43.85 
 
 
374 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  42.93 
 
 
390 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  42.74 
 
 
344 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  44.24 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  43.97 
 
 
375 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  43.05 
 
 
389 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  44.39 
 
 
374 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  43.97 
 
 
375 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  43.7 
 
 
375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  44.02 
 
 
371 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  42.61 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.01 
 
 
384 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.34 
 
 
360 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  43.39 
 
 
372 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  41.62 
 
 
345 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  44.12 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  43.87 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  42.06 
 
 
372 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1347  chemotaxis-specific methylesterase  42.56 
 
 
388 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  39.31 
 
 
379 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.16 
 
 
389 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  44.48 
 
 
349 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  42.59 
 
 
375 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  42.55 
 
 
371 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  40.92 
 
 
344 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  42.94 
 
 
362 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  42.05 
 
 
370 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.74 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.94 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  41.53 
 
 
393 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.38 
 
 
368 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  43.71 
 
 
357 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  38.99 
 
 
379 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.37 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.58 
 
 
364 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.82 
 
 
350 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  42.9 
 
 
374 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.64 
 
 
348 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  42.15 
 
 
381 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03140  chemotaxis-specific methylesterase  43.87 
 
 
371 aa  256  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  42.5 
 
 
358 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  41.01 
 
 
370 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  41.01 
 
 
370 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  40.17 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  41.62 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  44.02 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  41.35 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.06 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  41.62 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.17 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  38.17 
 
 
385 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  40.06 
 
 
355 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1971  chemotaxis-specific methylesterase  41.6 
 
 
381 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0873  protein-glutamate methylesterase  38.86 
 
 
352 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3867  chemotaxis-specific methylesterase  43.05 
 
 
368 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  38.67 
 
 
425 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  41.42 
 
 
388 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3424  chemotaxis-specific methylesterase  41.9 
 
 
354 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  40.8 
 
 
339 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  41.07 
 
 
376 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  40.97 
 
 
387 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.77 
 
 
363 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  40.47 
 
 
345 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.16 
 
 
386 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  34.97 
 
 
372 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45580  chemotaxis-specific methylesterase  42.16 
 
 
368 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  0.505657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  42.13 
 
 
356 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.4 
 
 
357 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.97 
 
 
354 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  41.24 
 
 
393 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.36 
 
 
382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1203  chemotaxis-specific methylesterase  41.48 
 
 
398 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.11 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.87 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  40.55 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.29 
 
 
382 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  43.36 
 
 
382 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  43.43 
 
 
380 aa  242  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.85 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.32 
 
 
352 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  39.95 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  39.95 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0943  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.45 
 
 
354 aa  239  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
349 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  40.28 
 
 
360 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  40.74 
 
 
353 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>