More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0109 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 		 348 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  68.7 
 
 		 345 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  67.45 
 
 		 340 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  64.81 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  54.89 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  55.59 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  50.81 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  56.14 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  51.88 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  54.31 
 
 		 358 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  51.86 
 
 		 363 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  52.02 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  51.43 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  51.43 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  52 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  52 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  52 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  50.86 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  51.43 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  49.43 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  50.6 
 
 		 349 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  53.52 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  51.34 
 
 		 348 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  51.59 
 
 		 354 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.63 
 
 		 377 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 364 aa  341  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  49.57 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  48.55 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  47.59 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  47.59 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  47.59 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0154  protein-glutamate methylesterase CheB  53.89 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  48.42 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  51.14 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  48.14 
 
 		 349 aa  335  5.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  49.71 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  51.28 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  47.86 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  48.15 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  48.73 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  48.73 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 349 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 349 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 349 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  48.58 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  48.3 
 
 		 363 aa  331  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  47.88 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.41 
 
 		 350 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.88 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.15 
 
 		 366 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  48.01 
 
 		 363 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.86 
 
 		 368 aa  322  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.44 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  48.19 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.09 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  47.97 
 
 		 352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.81 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  46.43 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  47.27 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.14 
 
 		 349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.42 
 
 		 349 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.14 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.14 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.35 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  47.56 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0781  chemotaxis-specific methylesterase  46.53 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0665  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.52 
 
 		 343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal  0.470947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  45.95 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  44.29 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  48.99 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.85 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.57 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.85 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.54 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  46.8 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.53 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.99 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0333  chemotaxis-specific methylesterase  47.25 
 
 		 347 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  44.99 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  43.85 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3626  chemotaxis-specific methylesterase  44.89 
 
 		 360 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1148  chemotaxis-specific methylesterase  43.84 
 
 		 359 aa  292  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.870616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>