More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2213 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  94.3 
 
 		 351 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  94.87 
 
 		 351 aa  681    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 		 351 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  83.29 
 
 		 351 aa  590  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  73.94 
 
 		 349 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  74.22 
 
 		 349 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  73.65 
 
 		 349 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  73.65 
 
 		 349 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00415  chemotaxis-specific methylesterase  52.01 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  53.78 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  52.03 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  54.44 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  52.15 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  50.72 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  50.72 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  50.14 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 350 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  50.29 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 349 aa  348  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  50.14 
 
 		 349 aa  348  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  51.01 
 
 		 349 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  51.01 
 
 		 349 aa  348  9e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  51.01 
 
 		 349 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  50.86 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  50.72 
 
 		 350 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  49.86 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  50.43 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  49.71 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  49.16 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  48.37 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  48.37 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  49.57 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  48.6 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  48.15 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  49.55 
 
 		 354 aa  328  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  46.89 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  47.46 
 
 		 363 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  46.89 
 
 		 362 aa  326  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  47.29 
 
 		 360 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  48.71 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  47.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  48.29 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  46.57 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  46.65 
 
 		 381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.69 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2711  chemotaxis-specific methylesterase  46.38 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  45.11 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  48.97 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  46.59 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.63 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  46.88 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  48.13 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.29 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  45.61 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.88 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  44.48 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  45.1 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.4 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  47.52 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.91 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.35 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  46.59 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  43.54 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.35 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1985  Protein-glutamate methylesterase  45.66 
 
 		 341 aa  299  6e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0052895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0333  chemotaxis-specific methylesterase  45.24 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.14 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.53 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  44.35 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  46.44 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  45.66 
 
 		 352 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  45.24 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  45.69 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.95 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0807  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.51 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.59 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0615  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.35 
 
 		 347 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0496998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  43.47 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.57 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.13 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.27 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>