More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3675 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  86.6 
 
 		 388 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 		 385 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  83.06 
 
 		 370 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  80.21 
 
 		 389 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  77.35 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  78.76 
 
 		 381 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  70.31 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.73 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  48.4 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.4 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.31 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.32 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  45.62 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.02 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.92 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.5 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.33 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.42 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.08 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.83 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.61 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.39 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.93 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  37.17 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.06 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  37.43 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  37.74 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  38.33 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  36.86 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  35.99 
 
 		 344 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  35.99 
 
 		 344 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.9 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.46 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  36.8 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  37.53 
 
 		 339 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 		 366 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.51 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  37 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.34 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  37.03 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.54 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  37.57 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  35.16 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.54 
 
 		 351 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  37.85 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  36.8 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  35.54 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  32 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.44 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  36.39 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.77 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.77 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  35.89 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  35.89 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  35.89 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  36.11 
 
 		 353 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  35.89 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.36 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  37.29 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.16 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.59 
 
 		 373 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0576  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.15 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.630025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.62 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  33.98 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.08 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  33.98 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  35.23 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  35.42 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  35.83 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  35.15 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  35.95 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.52 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  36.04 
 
 		 365 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.3 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.26 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2359  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.88 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.67 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.88 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  36.57 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.88 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  34.16 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  37.57 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  34.79 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.15 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  36.05 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2242  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.15 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.64 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3945  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.42 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  34.44 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.43 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>