More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3373 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  79.33 
 
 
425 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
381 aa  758    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  77.06 
 
 
388 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  78.35 
 
 
385 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  78.38 
 
 
370 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  76.53 
 
 
389 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  73.99 
 
 
393 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.49 
 
 
382 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  52.49 
 
 
382 aa  349  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.93 
 
 
382 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.59 
 
 
389 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  49.33 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.41 
 
 
386 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.34 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  39.9 
 
 
401 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.66 
 
 
419 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.77 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.42 
 
 
355 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.6 
 
 
352 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 
385 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.76 
 
 
353 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.87 
 
 
371 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  38.74 
 
 
357 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  38.44 
 
 
363 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  38.17 
 
 
385 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.95 
 
 
379 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  38.29 
 
 
358 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.98 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  37.6 
 
 
363 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.4 
 
 
370 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
349 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.34 
 
 
366 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  38.89 
 
 
353 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  38.78 
 
 
356 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  38.67 
 
 
362 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  41.44 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.59 
 
 
348 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  38.2 
 
 
349 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  38.2 
 
 
349 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  35.85 
 
 
344 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  35.85 
 
 
344 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.78 
 
 
340 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  38.2 
 
 
349 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  38.2 
 
 
350 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.16 
 
 
360 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.11 
 
 
354 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.02 
 
 
357 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  38.48 
 
 
350 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.65 
 
 
384 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  38.4 
 
 
349 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  37.22 
 
 
363 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  38.2 
 
 
350 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  37.6 
 
 
374 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 
379 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  37.92 
 
 
350 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  37.63 
 
 
374 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  36.51 
 
 
362 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  37.22 
 
 
360 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  37.22 
 
 
363 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  32.55 
 
 
376 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
348 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  37.78 
 
 
360 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  37.78 
 
 
360 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  37.78 
 
 
360 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
368 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.09 
 
 
364 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 
373 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  36.57 
 
 
339 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.93 
 
 
368 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  35.71 
 
 
345 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.23 
 
 
358 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  35.75 
 
 
345 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
349 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  36.89 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  36.89 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  38.06 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.13 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.02 
 
 
377 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  35.66 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  33.33 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.64 
 
 
351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  36.84 
 
 
364 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  36.29 
 
 
364 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.78 
 
 
384 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.86 
 
 
370 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.54 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  37.82 
 
 
349 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  37.82 
 
 
349 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  35.62 
 
 
374 aa  199  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  37.82 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  35.77 
 
 
356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  37.82 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  37.4 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  37.82 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  37.82 
 
 
349 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>