More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4244 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
389 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  82.67 
 
 
370 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  79.43 
 
 
385 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  79.43 
 
 
388 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  75.83 
 
 
393 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  76.53 
 
 
381 aa  558  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  69.01 
 
 
425 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.54 
 
 
382 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  50.4 
 
 
382 aa  345  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.49 
 
 
382 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.41 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  50.54 
 
 
386 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  48.1 
 
 
387 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.01 
 
 
419 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.02 
 
 
366 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.34 
 
 
352 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.32 
 
 
371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.49 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  38.2 
 
 
385 aa  235  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.08 
 
 
385 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.84 
 
 
370 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  37.63 
 
 
358 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.09 
 
 
353 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  38.11 
 
 
357 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.79 
 
 
340 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  37.9 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.64 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.5 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.54 
 
 
384 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  35.73 
 
 
344 aa  219  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  36.91 
 
 
363 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  35.73 
 
 
344 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.05 
 
 
366 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  40.11 
 
 
362 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.15 
 
 
360 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.19 
 
 
354 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  35.26 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  33.97 
 
 
345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  35.68 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  37.63 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.78 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.85 
 
 
348 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  36.59 
 
 
349 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  36.59 
 
 
349 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.78 
 
 
351 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  36.59 
 
 
349 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 
373 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  37.33 
 
 
349 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  37.33 
 
 
375 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  37.33 
 
 
375 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  35.52 
 
 
345 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  36.68 
 
 
349 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  34.93 
 
 
356 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  34.41 
 
 
344 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  36.09 
 
 
356 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  37.07 
 
 
363 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  36.53 
 
 
363 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  36.53 
 
 
360 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.42 
 
 
351 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
350 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  35.9 
 
 
359 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  36.06 
 
 
390 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  36.53 
 
 
349 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0880  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.08 
 
 
358 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0576  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.42 
 
 
343 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.630025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 
348 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
370 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  36.46 
 
 
371 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  32.12 
 
 
376 aa  206  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  36.27 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  35.5 
 
 
350 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36 
 
 
349 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
349 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  36.36 
 
 
357 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
370 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  34.96 
 
 
350 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.39 
 
 
368 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.09 
 
 
405 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 
394 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.22 
 
 
357 aa  202  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  37.4 
 
 
349 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
349 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2817  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.29 
 
 
364 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
349 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  37.3 
 
 
339 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  35.23 
 
 
350 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.2 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  34.96 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  36.34 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0908  protein-glutamate methylesterase CheB  35.98 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  36.04 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  36.34 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>