More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2002 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  100 
 
 
385 aa  776    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  65.41 
 
 
370 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  55.47 
 
 
366 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  53.28 
 
 
419 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  52.35 
 
 
371 aa  359  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.11 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.65 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.1 
 
 
352 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  48.9 
 
 
394 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.19 
 
 
365 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.43 
 
 
353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  40.71 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.78 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  38.63 
 
 
344 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.36 
 
 
344 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.75 
 
 
386 aa  249  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  36.87 
 
 
385 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  37.96 
 
 
370 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  41.02 
 
 
381 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.69 
 
 
382 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  40.43 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.95 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  38.95 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  36.07 
 
 
425 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
375 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
375 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  39.15 
 
 
349 aa  242  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.01 
 
 
361 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  39.73 
 
 
385 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.15 
 
 
376 aa  239  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  39.1 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  36.44 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  39.26 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.63 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  37.53 
 
 
365 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.36 
 
 
351 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  39.04 
 
 
393 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.41 
 
 
363 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.97 
 
 
351 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  35.85 
 
 
355 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 
349 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.78 
 
 
360 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
363 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  36.79 
 
 
390 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  36.66 
 
 
363 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1179  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 
368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.564706  normal  0.289977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  37.4 
 
 
377 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  39.04 
 
 
381 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  38.33 
 
 
357 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  35.48 
 
 
358 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  38.92 
 
 
379 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.05 
 
 
384 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  36.81 
 
 
356 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  35.26 
 
 
379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  37.53 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  36.59 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 
363 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.14 
 
 
354 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 
360 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
360 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
360 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
360 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  37.53 
 
 
370 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  34.97 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  37.85 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  37.08 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  36.99 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  36.44 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2711  chemotaxis-specific methylesterase  39.13 
 
 
350 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  34.99 
 
 
372 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0721  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.3 
 
 
350 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.83 
 
 
348 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  37.29 
 
 
349 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  36.73 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  37.27 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
349 aa  219  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 
363 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0873  protein-glutamate methylesterase  33.16 
 
 
352 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  34.93 
 
 
372 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  36.05 
 
 
350 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  35.85 
 
 
363 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.78 
 
 
361 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2160  chemotaxis-specific methylesterase  37 
 
 
365 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151682  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  36.68 
 
 
376 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  35.68 
 
 
370 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1200  chemotactic response regulator/methylesterase  35.01 
 
 
353 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.45 
 
 
366 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.21 
 
 
350 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 
339 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  36.96 
 
 
353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  37.8 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0906  chemotaxis-specific methylesterase  37.4 
 
 
351 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 
340 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.65 
 
 
367 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>