More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0523 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
387 aa  777    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  46.4 
 
 
425 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  49.59 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  49.33 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  46.93 
 
 
385 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  48.1 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  46.89 
 
 
393 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  48.01 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.78 
 
 
382 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  43.8 
 
 
382 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.23 
 
 
386 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.67 
 
 
382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.02 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.78 
 
 
405 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.01 
 
 
419 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.78 
 
 
355 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  37.89 
 
 
385 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.74 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.42 
 
 
366 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.03 
 
 
385 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.44 
 
 
352 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.71 
 
 
370 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.59 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.67 
 
 
376 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.03 
 
 
371 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.86 
 
 
368 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.53 
 
 
367 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  38.24 
 
 
349 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.17 
 
 
360 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 
369 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 
357 aa  217  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  39.04 
 
 
358 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0238  chemotaxis-specific methylesterase  38.5 
 
 
349 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 
353 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.85 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  35.73 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  37.91 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  36.94 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1530  chemotaxis-specific methylesterase  37.73 
 
 
370 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  37.04 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4337  chemotaxis-specific methylesterase  37.63 
 
 
370 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079226  normal  0.165639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.59 
 
 
348 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  36.02 
 
 
348 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  36.17 
 
 
372 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.63 
 
 
365 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  36.57 
 
 
345 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  37.14 
 
 
374 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4073  chemotaxis-specific methylesterase  38.69 
 
 
345 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.73 
 
 
378 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  37.87 
 
 
349 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  34.24 
 
 
365 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0978  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.23 
 
 
352 aa  209  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.75 
 
 
356 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  37.47 
 
 
349 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.53 
 
 
340 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  36.12 
 
 
353 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  36.7 
 
 
375 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  36.51 
 
 
372 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3663  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
374 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2711  chemotaxis-specific methylesterase  37.57 
 
 
350 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  36.16 
 
 
339 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.94 
 
 
384 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.12 
 
 
361 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3626  chemotaxis-specific methylesterase  38.1 
 
 
360 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2148  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  37.3 
 
 
352 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.32 
 
 
384 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.31 
 
 
354 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  36.7 
 
 
375 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2905  chemotaxis-specific methylesterase  36.44 
 
 
375 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3906  chemotaxis-specific methylesterase  36.53 
 
 
376 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0528472  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  34.51 
 
 
355 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3045  chemotaxis-specific methylesterase  34.93 
 
 
371 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  36.44 
 
 
375 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  38.07 
 
 
341 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1639  chemotaxis-specific methylesterase  35.11 
 
 
372 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  35.92 
 
 
354 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  36.02 
 
 
363 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  36.51 
 
 
345 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0333  chemotaxis-specific methylesterase  36.77 
 
 
347 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.12 
 
 
365 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  37.85 
 
 
390 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  37.53 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2801  chemotaxis-specific methylesterase  36.91 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  0.232099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  33.24 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  35.28 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3470  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.63 
 
 
345 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal  0.68065 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0154  protein-glutamate methylesterase CheB  35.22 
 
 
346 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1443  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 
341 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  34.97 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1737  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.99 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0465543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.11 
 
 
353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3581  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.78 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1387  chemotaxis-specific methylesterase  35.12 
 
 
369 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.925745  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.21 
 
 
362 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  35.52 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  35.52 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  35.52 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  35.52 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  35.52 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>