More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1607 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  239  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  93.28 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  77.78 
 
 		 119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2741  response regulator receiver protein  74.79 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000066775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  36.75 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  36.75 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  36.75 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  35.9 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  42.98 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  37.5 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 416 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3026  chemotaxis-specific methylesterase  43.93 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.98 
 
 		 486 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.83 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 417 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.93 
 
 		 355 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3271  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.238808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 1066 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  37.17 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 457 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2323  two component CheB methylesterase  47.66 
 
 		 370 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  38.79 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1693  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1382  chemotaxis-specific methylesterase  39.34 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  37.82 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0360  chemotaxis-specific methylesterase  38.33 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  35 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  39.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.62 
 
 		 456 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.62 
 
 		 456 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 457 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5134  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2276  chemotaxis-specific methylesterase  39.34 
 
 		 371 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.574924  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5429  sporulation initiation phosphotransferase F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.26925e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  33.91 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>