More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2037 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  100 
 
 
120 aa  239  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  84.17 
 
 
120 aa  208  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  80 
 
 
120 aa  199  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  74.17 
 
 
120 aa  191  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  74.14 
 
 
119 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  73.95 
 
 
120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  73.11 
 
 
120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  72.41 
 
 
119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  70 
 
 
120 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  70.83 
 
 
120 aa  178  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  71.19 
 
 
120 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  71.19 
 
 
120 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  66.67 
 
 
120 aa  176  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  65.83 
 
 
121 aa  175  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  68.64 
 
 
119 aa  173  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  66.39 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  67.83 
 
 
119 aa  171  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  68.1 
 
 
119 aa  170  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  67.23 
 
 
122 aa  169  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  65 
 
 
120 aa  167  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  65 
 
 
123 aa  166  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  64.17 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  70.43 
 
 
119 aa  163  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  156  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  60.5 
 
 
122 aa  156  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  60.5 
 
 
122 aa  155  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  60.5 
 
 
122 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  60.5 
 
 
122 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  61.34 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  63.79 
 
 
117 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  60.5 
 
 
122 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  56.52 
 
 
119 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  59.17 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  59.17 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  59.17 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  57.5 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  59.13 
 
 
118 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  56.9 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  55.17 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  50.86 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  50.83 
 
 
120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  50.86 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  50 
 
 
121 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  49.58 
 
 
120 aa  124  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
123 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  47.9 
 
 
120 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 
122 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  49.14 
 
 
234 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
119 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  43.22 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
119 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
120 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  45.76 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
123 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
123 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
117 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
121 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
118 aa  103  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 
120 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
120 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 
125 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 
125 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
120 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
118 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  40 
 
 
122 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  38.26 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  41.03 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.23 
 
 
350 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
1066 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0161  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 
169 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
147 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  40 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
207 aa  87.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.61 
 
 
391 aa  87.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  40.78 
 
 
119 aa  87.8  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
226 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  31.36 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0315  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.48267  normal  0.327834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  33.33 
 
 
209 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  37.7 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  37.29 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>