More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0064 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  100 
 
 
119 aa  236  5.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
120 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
120 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
120 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
119 aa  104  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  44.92 
 
 
121 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
122 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
120 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  47.12 
 
 
122 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
120 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
122 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  41.96 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  43.27 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  39.13 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  40 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  39.32 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
120 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
118 aa  93.6  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.07 
 
 
119 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
117 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  41.9 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  41.9 
 
 
122 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  43.27 
 
 
120 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
122 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  41.9 
 
 
122 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
118 aa  91.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
117 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
1066 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  36.94 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  36.52 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  44.66 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  40.38 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0170  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
128 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000628912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 
225 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
230 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0157  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  40.78 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  37.72 
 
 
391 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
120 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
120 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 
218 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1193  response regulator receiver protein  41 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  40.95 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0692  CheY  42.45 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0775756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  45.1 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  43.56 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
214 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 
230 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  45.1 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 
229 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  37.9 
 
 
235 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  41.96 
 
 
454 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  41.12 
 
 
237 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3647  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.09 
 
 
451 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
452 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  47.12 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>