More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1193 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1193  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  227  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  41 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  35 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  41 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  39 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 1066 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  36.63 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  35.51 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38 
 
 		 335 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  30 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3098  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.25 
 
 		 491 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  35.24 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  35.9 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.27 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  35.92 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 507 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.77 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  36.44 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  37.74 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0377  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.19 
 
 		 314 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 470 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>