More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3861 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  86.11 
 
 		 182 aa  333  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  86.59 
 
 		 181 aa  331  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  84.44 
 
 		 181 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  84.83 
 
 		 181 aa  325  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  83.71 
 
 		 181 aa  322  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  88.05 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  47.77 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  49.03 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  36.11 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  35.97 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 157 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 132 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.52 
 
 		 133 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  39.17 
 
 		 128 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 129 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 129 aa  94.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 133 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.18 
 
 		 129 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 133 aa  94.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.34 
 
 		 131 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40.17 
 
 		 129 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  92  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.07 
 
 		 134 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 139 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  38.46 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  38.46 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  38.46 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  36.75 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 127 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 128 aa  89  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 128 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  38.14 
 
 		 129 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 132 aa  88.2  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 126 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 132 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 131 aa  87.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 131 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 126 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 127 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 129 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.01 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 126 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 126 aa  86.3  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 127 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.9 
 
 		 128 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 123 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  85.5  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 131 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>