More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0143 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  90.91 
 
 		 158 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  93.24 
 
 		 158 aa  279  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  93.24 
 
 		 158 aa  279  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  88.31 
 
 		 159 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  88.31 
 
 		 159 aa  275  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  71.62 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  38.19 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 		 181 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  35.1 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  35.1 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  36.42 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  33.11 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  35.17 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.4 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 183 aa  90.5  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  34.69 
 
 		 316 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2159  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.691441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  35.29 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  34.96 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 524 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  34.96 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 524 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  32.79 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  31.45 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  30 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  30 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  32 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  29.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  29.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  30 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  30.65 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  30.65 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  30.08 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  27.42 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  29.84 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  30.08 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  28.23 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  30 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.88 
 
 		 1987 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  28.23 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  29.84 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  26.61 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>