More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0528 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  310  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  72.3 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  71.62 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  71.33 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  70.67 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  70.67 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  71.62 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  35.1 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  35.1 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  33.77 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  34.51 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  35.92 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.56 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 183 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  30.65 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  29.27 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  32.52 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  30.89 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.52 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  36.13 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2159  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.691441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.61 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  29.6 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  28 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  28 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  30.82 
 
 		 316 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  30.4 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  29.27 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  31.97 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  28 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  29.6 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  25.81 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  26.4 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  28 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  28 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  29.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  29.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>