More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0423 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  100 
 
 		 175 aa  346  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  40.13 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  35.33 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  34.67 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  37.76 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  34.38 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.76 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  35.46 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 127 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.06 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  33.06 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  30.41 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32.8 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  32 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  30.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  33.06 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  28.47 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  40.21 
 
 		 233 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  33.33 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 818 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.81 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 452 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.81 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.06 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  32.26 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>