More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1223 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  58.06 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  50.96 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 181 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  48.72 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  45.51 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  49.37 
 
 		 182 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  49.03 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  48.72 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  48.94 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  47.8 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  40.13 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  38.13 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  38.13 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 228 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 194 aa  94.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 129 aa  91.3  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2505  response regulator receiver domain-containing protein  34.9 
 
 		 316 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  37.6 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  37.5 
 
 		 131 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 127 aa  87.8  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.9 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  36.29 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 197 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  37.6 
 
 		 129 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 133 aa  85.1  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  37.6 
 
 		 129 aa  85.1  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  37.6 
 
 		 129 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  36.8 
 
 		 129 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  84.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  34.43 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  34.43 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1841  response regulator receiver protein  35 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  35.25 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  34.62 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  35.2 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 395 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2159  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.691441 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 266 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  32.79 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  33.59 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  33.59 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  35.2 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 131 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  35.2 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  35.2 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>