More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0286 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  48.81 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  33.95 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  34.03 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  32.41 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  31.48 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  31.48 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 173 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.2 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  30.53 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3942  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3531  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  30.99 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  32.17 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  32.17 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4352  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 414 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  30.43 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.65 
 
 		 869 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  31.3 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  30.43 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.37 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  29.57 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  30.43 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  29.77 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  37.61 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  31.3 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  31.03 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 395 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 126 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  34.55 
 
 		 266 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  30.43 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0601  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 265 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  32.46 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.48 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  32.17 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  29.57 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  29.57 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1680 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  30.83 
 
 		 667 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>